זיקוק מולקולרי (MD) היא טכנולוגיית הפרדת נוזל-נוזל בתנאי ואקום גבוה, המתאימה במיוחד להפרדה של חומרים בעלי נקודת רתיחה גבוהה, רגישים לחום וניתנים לחמצון בקלות. מכיוון שזיקוק מולקולרי יכול לבצע הפרדה משנית על המוצרים המתקבלים על ידי מיצוי פחמן דו חמצני סופר קריטי ולהפריד באופן סלקטיבי את מוצר המטרה, השילוב של SFE-MD יכול להשיג מוצרים בעלי טוהר גבוה שקשה להשיג בשיטות הפרדה אחרות. שמן הפשתן האתרי בפשתן מופק על ידי טכנולוגיית מיצוי פחמן דו חמצני סופר-קריטית, ולאחר מכן התמצית המתקבלת מופרדת דק על ידי זיקוק מולקולרי. תנאי ההפרדה המתאימים הם טמפרטורת זיקוק 90-105 מעלות, לחץ פעולה 0.3-1.8 Pa, טמפרטורת הזנה 60 מעלות, קצב הזנה 90-100 מ"ל/שעה, ומהירות המגרד 150 סל"ד לדקה. לאחר זיקוק מולקולרי בן ארבעה שלבים, ניתן לטהר את החומצה -לינולנית בחומר הגלם מ-67.5% ל-82.3% המקוריים. שמן אתרי ציפורן מופק על ידי נוזל פחמן דו חמצני סופר קריטי, ולאחר מכן מזוקק על ידי טכנולוגיית זיקוק מולקולרי (MD). השמן האתרי המתקבל מנותח על ידי GC-MS. תוצאות הניסוי מראות כי לאחר זיקוק מולקולרי, תכולת ה-GC של אאוגנול עלתה מ-67.56% המקורי (שיטת SCDE) ל-68.75%, הצבע והנזילות של השמן האתרי שופרו משמעותית, והאיכות השתפרה משמעותית.
